Coronavirus: una amplia familia de virus no tan nueva / Coronavirus: A viruses wide family not so new

Empiezo esta comunicación, invitándolos a una breve reflexión acerca del manejo de la información que se recibe y difunde en estos tiempos de pandemia. Ante la emergencia sanitaria que se vive en el mundo por la expansión de la Covid-19, uno de los aspectos que se pro-paga rápidamente y es igual de peligroso que el propio virus son las noticias falsas y la desinformación, lo cual ha generado un fenómeno que la Organización Mundial de la Salud (OMS) nombró como infodemia. Otro fenómeno que acompaña a la pandemia de la covid-19 es la infoxicación. Es decir, la sobrecarga informativa. Por ejemplo, realizando una búsqueda el dia 6 de mayo de 2020 en google empleando las palabras coronavirus covid-19, el buscador nos arroja 2,800,000,000 de resultados asocia-dos a la búsqueda, lo cual representa un cúmulo de información y ello se magnifica en importancia si se tiene en cuenta lo relativamente nueva que es la pandemia.

Introducción a la virología I / Introduction to virology I

Los virus han acompañado al hombre a través de toda su historia, provocando infecciones y plagas que han generado la muerte y el temor de poblaciones completas. Muchos han sido los investigadores que han contribuido a conocer la estructura, patogenia e inmunidad involucrada. Es fundamental conocer los aspectos básicos de los virus para entender la enfermedad y el tratamiento, por lo que esperamos contribuir a esto con los apuntes que a continuación presentamos...(AU)

Viruses have accompanied humankind through their history, causing infections and producing death and fear in population. A lot of researchers have contributed to know the structure, pathogeny and immunity involved. To understand the disease and treatment is fundamental to know the basic aspects, which is the reason to present these notes...(AU)

Trichoderma harzianum MTCC 5179 impacts the population and functional dynamics of microbial community in the rhizosphere of black pepper (Piper nigrum L )

Abstract Employing Illumina Hiseq whole genome metagenome sequencing approach, we studied the impact of Trichoderma harzianum on altering the microbial community and its functional dynamics in the rhizhosphere soil of black pepper (Piper nigrum L.). The metagenomic datasets from the rhizosphere with (treatment) and without (control) T. harzianum inoculation were annotated using dual approach, i.e., stand alone and MG-RAST. The probiotic application of T. harzianum in the rhizhosphere soil of black pepper impacted the population dynamics of rhizosphere bacteria, archae, eukaryote as reflected through the selective recruitment of bacteria [Acidobacteriaceae bacterium (p = 1.24e-12), Candidatus koribacter versatilis (p = 2.66e-10)] and fungi [(Fusarium oxysporum (p = 0.013), Talaromyces stipitatus (p = 0.219) and Pestalotiopsis fici (p = 0.443)] in terms of abundance in population and bacterial chemotaxis (p = 0.012), iron metabolism (p = 2.97e-5) with the reduction in abundance for pathogenicity islands (p = 7.30e-3), phages and prophages (p = 7.30e-3) with regard to functional abundance. Interestingly, it was found that the enriched functional metagenomic signatures on phytoremediation such as benzoate transport and degradation (p = 2.34e-4), and degradation of heterocyclic aromatic compounds (p = 3.59e-13) in the treatment influenced the rhizosphere micro ecosystem favoring growth and health of pepper plant. The population dynamics and functional richness of rhizosphere ecosystem in black pepper influenced by the treatment with T. harzianum provides the ecological importance of T. harzianum in the cultivation of black pepper.

Evaluation of skimmed milk flocculation method for virus recovery from tomatoes

Abstract This study aimed to evaluate the elution-concentration methodology based on skimmed milk flocculation from three varieties of tomatoes (Solanum lycopersicum L. [globe], Solanum lycopersicum var. cerasiforme [cherry] and hybrid cocktail [grape tomato]) for further monitoring of field samples. Spiking experiments were performed to determine the success rate and efficiency recovery of human norovirus (NoV) genogroup II, norovirus murine-1 (MNV-1) used as sample process control virus and human adenovirus (HAdV). Mean values of 18.8%, 2.8% and 44.0% were observed for NoV GII, MNV-1 and HAdV, respectively with differences according to the types of tomatoes, with lower efficiency for cherry tomatoes. Analysis of 90 samples, obtained at commercial establishments in the metropolitan region of Rio de Janeiro State, revealed 4.5% positivity for HAdV. Bacterial analysis was also performed with no detection of Salmonella spp., L. monocytogenes and fecal coliforms. Data demonstrated that the skimmed milk flocculation method is suitable for recovering HAdV from tomatoes and highlights the need for considering investigation in order to improve food safety.

Survey of pathogens in threatened wild red-tailed Amazon parrot (Amazona brasiliensis) nestlings in Rasa Island, Brazil

ABSTRACT The red-tailed Amazon parrot (Amazona brasiliensis) is a threatened species of psittacine bird that inhabit coastal regions of Brazil. In view of the threat of this species, the aim of this study was to perform a health evaluation in wild nestlings in Rasa Island, determining the prevalence of enterobacteria and infectious agents according to type of nest. Blood samples were collected from 64 birds and evaluated for antibodies of Chlamydia psittaci by commercial dot-blot ELISA. Cloacal and oropharyngeal swabs samples were collected from 23 birds from artificial wooden nests, 15 birds from PVC nests and 2 birds from natural nests for microbiological analysis. Swab samples were collected from 58 parrots for C. psittaci detection by PCR and from 50 nestlings for Avian Influenza, Newcastle Disease and West Nile viruses' detection analysis by real-time RT-PCR. Ten bacterial genera and 17 species were identified, and the most prevalent were Escherichia coli and Klebsiella oxytoca. There was no influence of the type of nest in the nestlings' microbiota. All samples tested by ELISA and PCR were negative. There is currently insufficient information available about the health of A. brasiliensis and data of this study provide a reference point for future evaluations and aid in conservation plans.

Detection of respiratory viruses in shelter dogs maintained under varying environmental conditions

Abstract Three dog shelters in Rio Grande do Sul were investigated for associations between the occurrence of respiratory viruses and shelter environmental conditions. Nasal secretions randomly collected during the cold season were tested via PCR, and this data collection was followed by nucleotide sequencing of the amplicons. In shelter #1 (poor sanitary and nutritional conditions, high animal density and constant contact between dogs), 78% (58/74) of the nasal samples were positive, 35% (26/74) of which were in single infections and 44% (32/74) of which were in coinfections. Shelters #2 and #3 had satisfactory sanitary and nutritional conditions, outdoors exercise areas (#2) and animal clustering by groups (#3). In shelter #2, 9% (3/35) of the samples were positive for Canine parainfluenza virus (CPIV), and 6% (2/35) were positive for Canid herpesvirus 1 (CaHV-1). In shelter #3, 9% (7/77) of the samples were positive for Canine adenovirus type 2 (CAdV-2), and 1% (1/77) were positive for Canine distemper virus (CDV). The amplicon sequences (CPIV and CDV nucleoprotein gene; CAdV-2 E3 gene; CaHV-1 glycoprotein B gene) showed 94-100% nucleotide identity with GenBank sequences. Our results demonstrate that CPIV, CAdV-2 and CDV are common in dog shelters and that their frequencies appear to be related with environmental and nutritional conditions. These results indicate the need for control/prevention measures, including vaccination and environmental management, to minimize these infections and improve dog health.

Virologia ambiental e saneamento no Brasil: uma revisão narrativa / Environmental virology and sanitation in Brazil: a narrative review / Virología ambiental y saneamiento en Brasil: una revisión narrativa

Os serviços de saneamento básico têm papel fundamental no controle da transmissão de diversos agentes patogênicos de veiculação hídrica, especialmente vírus responsáveis por causar gastroenterites agudas e hepatites. Entre os agentes virais de maior impacto para a saúde pública, podem ser destacados os vírus das hepatites A, os rotavírus e norovírus, adenovírus e enterovírus, os quais são responsáveis pela contaminação de diversos ecossistemas aquáticos brasileiros. A alta circulação de vírus no ambiente vem sendo relacionada às condições sanitárias inadequadas das comunidades, incluindo a falta na cobertura de serviços ou ineficácia de tecnologias convencionais na eliminação ou redução da carga viral presente na água ou no esgoto. Este estudo aborda uma revisão das relações entre virologia, saúde e saneamento, enfatizando a epidemiologia das infecções virais de transmissão hídrica e o impacto na saúde pública.

Sanitation services play a critical role in controlling transmission of numerous waterborne pathogens, especially viruses that cause acute gastroenteritis and hepatitis. The viral agents with the greatest public health impact are hepatitis A virus, rotaviruses and noroviruses, adenoviruses, and enteroviruses, contaminating many Brazilian aquatic ecosystems. Heavy circulation of viruses in the environment has been related to inadequate local sanitary conditions, including incomplete coverage of services or inefficacy of conventional technologies in eliminating or reducing the viral load in water or sewage. This study reviews the relations between virology, health, and sanitation, emphasizing the epidemiology of waterborne viral infections and their public health impact.

El servicio de saneamiento posee un rol en el control de la transmisión de muchos patógenos transmitidos por el agua, especialmente aquellos virus responsables de causar gastroenteritis aguda y hepatitis. Entre los agentes virales de mayor impacto sobre la salud pública se pueden destacar los virus de la hepatitis A, rotavirus, norovirus, adenovirus y enterovirus, los cuales son responsables de la contaminación de diversos ecosistemas acuáticos brasileños. Una alta circulación del virus en el medio ambiente se relaciona con condiciones sanitarias inadecuadas de las comunidades, como la falta de cobertura de los servicios o la ineficacia de las tecnologías convencionales en eliminar la carga viral del agua. Esta revisión está enfocada en las relaciones entre la virología, la salud y el saneamiento, con énfasis en la epidemiología de las infecciones virales transmitidas por el agua y el impacto en la salud pública.

Las encefalitis esquinas: Una Revisión / The equine encephalitis: a review

El grupo de las encefalitis Equina Venezolana, del Este, del Oeste y del Nilo Occidental (EEV, EEE, EEO y ENO respectivamente) son zoonosis transmitidas por mosquitos a humanos y equinos. Este grupo de enfermedades se mantienen en la naturaleza en ciclos enzoóticos de transmisión entre mosquitos y roedores silvestres o aves que son sus hospedadores naturales. La circulación de estos virus es enzoótica y ocurre en áreas geográficas definidas y tienen capacidad de causar epidemias/epizootias con morbilidad y mortalidad que puede ser de importancia significativa. Este artículo describe detalladamente todas las encefalitis virales que afectan a los équidos y sus aspectos clínicos, patológicos y diagnósticos.

The encephalitis of Venezuelan Equine, Eastern, Western and West Nile (VEE, EEE, WEE and ENO respectively) are zoonotic encephalitis transmitted by mosquitoes to humans and horses. This group of diseases is maintained in nature in cycle’s enzootic transmission between mosquitoes and wild rodents or birds are their natural hosts. The circulation of this virus is enzootic and occurs in defined geographical areas but is capable of causing epidemics / epizootics with morbidity and mortality can be significant importance. This article describes all viral encephalitis affecting equines and their clinical, pathological and diagnostic aspects.

Infección en pacientes con inflamación y enfermedad pulmonar obstructiva crónica o asma / Infection in patients with chronic obstructive pulmonary disease and inflammation of asthma

Objetivo: Determinar la frecuencia de infección viral y bacteriana en inflamación aguda de pacientes con enfermedad pulmonar obstructiva crónica o asma. Material y Métodos: Se incluyeron 140 pacientes; 46 con enfermedad pulmonar obstructiva crónica y 94 con asma, todos con inflamación aguda del aparato respiratorio y edades entre 20 a 70 años y como grupo de control 80 pacientes con inflamación aguda por infección respiratoria aguda sin antecedentes de enfermedad pulmonar crónica o asma. Se tomo muestra de exudado nasofaringeo para el aislamiento viral y bacteriano y se dio seguimiento para ver la evolución. Resultados: El 49 por ciento de los pacientes del grupo de trabajo presentaron infección viral y 13 por ciento infección bacteriana, el virus más frecuente fue parainfluenza, los casos más severos se observaron en este grupo. En el grupo control, 55 por ciento presentó infección viral, el más frecuente fue parainfluenza. Conclusiones: Los virus son agentes importantes que pueden incrementar la inflamación aguda en pacientes con enfermedad pulmonar obstructiva crónica o asma, generalmente son los mismos que infectan a personas sin daño previo, pero las infecciones pueden ser más severas cuando hay un daño del aparato respiratorio

Estudio terapéutico fase II: prospectivo, no aleatorio, con interferon alfa 2b recombinante en infección del cuello uterino por virus papiloma humano (VPH) y su uso como inmuno prevención del carcinoma cervical / Prospective, not randomized, phase II therapeutic study with recombining alpha-II interferon in human papillome virus (HPV) cervix infection and its use as inmune prevention from cervical carcinoma

Las ventajas que ofrece este tratamiento son: 1.Resulta un tratamiento efectivo para el primer eslabón de la cadena productora del Carcinoma del Cuello Uterino como lo es la infección por VPH con sus múltiples cepas oncogénicas que resultó ser sensible al mismo con valor estadísticamente significativo. (P<0.002 y P>0.04). A los 33 meses de observación 5/14 (37.5 por ciento) de todo el grupo ó 5/8 (62.4 por ciento) del grupo que obtuvo respuesta completa están libres de enfermedad con el Cuello Uterino sano. 2.Es no invasivo y es totalmente inocuo para el Cuello Uterino. 3. Es bien tolerado sin efectoS colaterales o secundarios indeseables. 4.Se puede administrar totalmente ambulatorio. 5.Es de costo razonable. 6.Viene a llenar una necesidad terapéutica, asistencial y epidemiológica de importancia para la población

Ocurrencia de crioglobulinemia en donantes de sangre del Hospital Universitario de Caracas con Hepatitis C confirmada: relación clínico epidemiológica / Occurence of cryoglobulinemia in blood donors of Hospital Universitario de Caracas with C viral hepatitis confirmed: clinical epidemiology relation

Debido a la fuerte asociación entre crioglobulina mixta (CM) y virus de hepatitis C (VHC) reportada entre 36-98 por ciento y con el objeto de investigar esta situación en población asintomática, en nuestro estudio determinamos la ocurrencia de crioglobulinas en donantes del banco de sangre con VHC confirmado. Estudiamos 62 donantes, divididos en tres grupos: grupo A:ELISA (enzyme-linked immunobsorvent assay) II-III positivo, RIBA (recombinant inmunoblot assay) 2.0 positivo; grupo B:ELISA positivo, RIBA negativo; grupo C:ELISA negativo. A los tres grupos se les determinó crioglobulinas y se tipificaron las positivas (valor positivo mayor de 0,5 mg/ml), al mismo tiempo ALT, AST (valor positivo mayor de 50 UI) y GGt (valor positivo mayor de 32 UI en mujeres y mayor de 50 UI en hombres). Crioglobulinas positivas estuvo presente en 10/13 del grupo A, 1/17 del grupo B y 8/32 del grupo C. Encontreamos:grupo A Vs B (p=0,00009049 por Fisher; y a Vs C (X²= 10,38; df=1; p=0,000127). La tipificación mostró predominio de inmunoglobulina G en el grupo A: 10/10, y sólo 1/8 del grupo C. No hubo relación entre elevación de aminotransferasas y GGt con crioglobulinas positivas. Los promedios más altos de aminotrasferasas y crioglubulinas se apreciaron en el grupo A. La ocurencia de VHC en el banco de sangre del Hospital Universitario de Caracas fue de 0,46 por ciento anual por método de ELISA. La infección por VHC está asociada con crioglobulinas positivas aún durante el período asintomático y no como manifestación tardía, sin que éstas tengan relación con aminotrasferasas elevadas

Encefalitis equina venezolana: estudio clínico y de laboratorio en pacientes pediátricos / Venezuelan equine encephalitis: clinical and laboratory study in pediatric patients

Se hizo el estudio clínico y de laboratorio de nueve niños con encefalitis producida por el virus de la encefalitis equina Venezolana, demostrado por aislamiento del virus y por la prueba de inhibición de la hemaglutinación. Casi todos los pacientes tenían anticuerpos demostrables en el séptimo día de evolución de la enfermedad. El examen clínico indica que los síntomas y signos más frecuentes fueron: fiebre, convulsiones y otras manifestaciones de excitación cortical. Los exámenes hemáticos revelaron leucocitosis inicial con ulterior tendencia hacia leucopenia. Con fórmula leucocitaria normal al comienzo seguida de neutropenia en la mayoría de los casos. El líquido cefalorraquídeo presentó pleocitosis con linfocitos en dos casos y neutrófilos en otro. Hubo hiperglucorraquia en el 50 por ciento de los niños y aumento de la albúmina raquídea. Las pruebas cualitativas para globulinas fueron positivas en tres oportunidades

La causa del SIDA es el VIH: evidencias clínicas, etiopatogénicas, epidemiológicas y experimentales / HIV is cause of sida: clinic evidence, etiopathogenic, epidemiologist and experimental

Los primeros casos del Síndrome de Inmunodeficiencia Adquirida (SIDA) fueron identificados en los Estados Unidos en 1981 y rapidamente esta enfermedad se ha convertido en una de las mayores amenazas para la salud pública mundial. El virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) fue aislado por primera vez en 1983. Numerosas investigaciones posteriores confirmaron su papel etiológico en el SIDA, aunque todavía existen algunas interrogates en relación a varios aspectos clínicos, etiopatogénicos y epidemiológicos de dicha enfermedad. Esas interrogantes llevaron a un reducido número de científicos a dudar de la relación etiológica VIH/SIDA. En este artículo se describe brevemente dicha controversia y se discuten las evidencias clínicas, etiopatogénicas, epidemiológicas y experimentales que apoyan esta relación etiológica. Esas evidencias se analizan a la luz de los postulados de Koch, concluyéndose que la asociación VIH/SIDA es probablemente más sólida que otras enfermedades virales, y que hoy en día no es justificable ninguna duda sobre el papel etiológico del VIH en el SIDA

El impacto de la biología molecular en el estudio de las infecciones virales / The impact of molecular biology in the study of viral infections

El desarrollo de las técnicas de biología molecular ha sido trascendental para el avance de la Virología en la última década. En esta revisión se presentan algunos de los avances más importantes que ha generado el estudio de dos de los virus con mayor impacto en los últimos años y en donde la aplicación de esa metodología ha sido crucial. La primera parte corresponde al VIRUS HERPES SIMPLE (HSV) cuya complejidad genética es asombrosa ya que posee como material genético un DNA de doble cadena, con 152 kilopares de bases, que presenta aproximadamente 75 marcos de lectura (ORF), que pueden codificar por lo menos para unas 72 proteínas diferentes. Estos genes se expresan durante el ciclo viral a través de un proceso altamente regulado y coordinado, como se observa en las neuronas del sistema nervioso central, a diferencia de lo que ocurre durante la latencia en neuronas sensoriales, en donde estos genes están apagados. El otro virus analizado es el VIRUS DE LA INMUNODEFICIENCIA HUMANA (HIV), el cual es un ejemplo de la enorme cantidad de información que se ha generado en menos de una década de estudio y que ha conducido no sólo a la elaboración del mapa genético viral de los genes estructurales (gag, pol y env), sino que también se han identificado por lo menos otros siete genes adicionales, cuya función es la regulación o modulación de la expresión genética viral. En relación a la patogénesis del síndrome de inmunodeficiencia adqirida (SIDA), se sabe que éste se desarrolla varios años después de la infección viral inicial; sin embargo, la replicación viral ocurre como un proceso continuo, aún en ausencia de infección clínica, lo que sugiere que la infección por HIV se inicia como un proceso caracterizado por una replicación viral persistente y una progresiva disfunción inmunológica.